La race du Chien nu du Pérou possède des origines très anciennes. Des fouilles archéologiques ont, en effet, permis de retrouver des objets en céramique où des chiens ressemblant au Chien nu du Pérou sont représentés et qui appartenaient à diverses cultures antérieures aux Incas, notamment la civilisation Chancay (entre 1200 et 1470 de notre ère).