Tout comme ses 2 proches cousins (le Griffon Belge et le Petit Brabançon), le Griffon Bruxellois descend d'un petit chien à poil dur : le Smousje. Ce dernier trouve ses origines dans la région bruxelloise. Le Griffon Bruxellois a bénéficié d'apports d'autres races de petite taille, comme le  King Charles Spaniel Ruby et le Carlin, pour se rapprocher de son standard actuel. 2 Griffons Bruxellois prénommés Topsy et Foxine sont les premiers représentants de la race à avoir été inscrits au Livre des Origines St. Hubert en 1883. Le Griffon Bruxellois a par la suite connu un grand succès dans le royaume et ailleurs dans le monde. Il a été reconnu à titre définitif par la Fédération Cynologique Internationale (FCI) le 26 octobre 1954. Son standard FCI officiel en vigueur a été publié en mars 2003.